薪資扣繳是企業最常詢問項目之一，官員表示，依據《薪資所得扣繳辦法》規定，薪資扣繳有二種方式，一般而言，不論是公營事業或私人公司，按月給付給員工的薪資，應該要請受領人填報免稅額申報表，有填表的員工，就是依據當年度政府頒布的《薪資所得扣繳稅額表》所訂金額來辦扣繳。
以今年為例，通常依循上述管道填表的員工，月薪在84,501以下，雇主都可以不必代辦薪資扣繳。
不過特別針對非月薪制員工、兼職員工以及未填表的月薪制員工，則要走第二種管道；官員表示，企業給付這幾類員工薪資時，原則上就是按照給付總額來扣取5％所得稅。
但可以留意起扣點規定，如果應扣稅額未達2,000元，可以免辦扣繳，用5％來換算，而一次性給付薪資在40,000元以下，雇主都還不必煩惱扣繳義務。
官員表示，針對這些國內員工扣繳的所得稅，雇主都得在隔月10日前向國庫繳清，並於隔年1月底前辦理扣繳憑單申報。
以上二種管道都是針對國內員工的做法，如果是外籍員工的話，又可能有不同規定。